środa, 14 października 2020

Genealogia genetyczna - oszacowania etniczne

 Poniżej podsumujemy uaktualnione (wersja 3.0) wyniki przynależności etnicznej ("My Origins") naszych próbek DNA zbadanych przez firmę FTDNA (Family Tree DNA). W skrócie - oszacowania te są obarczone wysokim ryzykiem błędu (niezależnie od firmy, która badanie wykonywała), a poniższy wpis pokaże ciekawy przykład tego, jak "pochodzenie" może powstać z niczego. Naszym zdaniem dużo bardziej miarodajne jest analizowanie dopasowań DNA i próba umiejscowienia wspólnych przodków w jednym drzewie genealogicznym, choć wymaga to więcej pracy i może dać niejednoznaczne odpowiedzi, zwłaszcza jeśli nasze dopasowania nie mają zbyt rozbudowanego "papierowego" drzewa genealogicznego.

 

Badanie DNA zrobiliśmy groupie spokrewnionych osób z w sumie 4 pokoleń.

  • Pokolenie 3 - brat pradziadka A, prababcia B, pradziadek C, prababcia D
(ze względu na to, że pradziadek A już nie żyje, badanie zrobiliśmy jego bratu)
  • Pokolenie 2 - dziadek E, babcia AB, dziadek F, babcia CD
  • Pokolenie 1 - rodzic EAB i rodzic FCD
  • Pokolenie 0 - dziecko ABCDEF

Litery AB przy babci oznaczają, że jej rodzicami są pradziadek A i prababcia B. Dla dziadków E i F nie mieliśmy możliwości przebadania ich rodziców, dlatego dostali oni swoje osobne literki. Rodzic EAB jest potomkiem dziadka E i babci AB, a wnukiem osób A i B. Dziecko ABCDEF jest potomkiem - genetycznym "miksem" - osób A, B, C, D, E i F.

(Dla osób ciekawych tego, dlaczego przebadaliśmy osoby AB, EAB etc. skoro dla genealogii wystarczą nam najstarsze pokoleniem próbki A, B C, itd. - wyniki DNA z tej firmy można przenieść do innych platform, które oferują analizę genów pod kątem zdrowotnym i to było naszą motywacją.)


Poniżej wyniki przynależności etnicznej dla wszystkich 11 wyżej wymienionych osób.

A

  • 83% West Slavic
  • 6% Scandinavia
  • <3% Middle East
  • <3% Southern Caucasus
  • 5% Greece & Balkans
  • 3% Ireland

B

  •  77% West Slav
  • 8% East Slavic 
  • 9% Central Europe
  • 6% Northern Levant
  • <1% Sephardic Jewish

C

  • 64% West Slav
  • 21% East Slav
  • 12% Baltic
  • 4% Ashenazi Jewish

D

  •  46% West Slavic
  • 5% Magyar
  • 14% Baltic
  • 35% Central Europe

E

  • 38% West Slavic
  • 22% East Slavic
  • 15% Baltic
  • 9% Greece & Balkans
  • 5% Iberian Peninsula
  • 12% Central Europe

F

  • 42% West Slavic
  • 12% East Slavic
  • 16% Magyar
  • 31% Baltic

Jak dotąd wyniki ciekawe, może niespodziewane (północny Lewant? wow), ale na pierwszy rzut oka w porządku. Przejdźmy do kolejnych pokoleń.

AB

  • 92% West Slavic
  • 5% Ireland 
  • <3% Southern Caucasus
  • <1% Malta & Sicily

Tu pierwsza zagwozdka. Osoby A i B nie mają Malty i Sycylii, a procent Irlandii to tylko 3% u osoby A i zero u osoby B, natomiast osoba AB ma oszacowane 5%. Teoretycznie można to sobie jeszcze wytłumaczyć tym, że A dla AB jest stryjem, a nie ojcem.

CD

  • 42% West Slav
  • 14% East Slav
  • 11% Baltic
  • 14% Greece & Balkans
  • 15% Central Europe
  • 3% Ashenazi Jewish

Tu kolejny problem. Osoby C i D nie mają nic z Greece & Balkans, natomiast ich dziecko AB ma aż 14%.

EAB

  • 43% West Slav
  • 23% Magyar
  • 13% Baltic
  • 7% Greece & Balkans 
  • 2% Malta & Sicily
  • 7% Great Britain
  • 5% Ireland

Region węgierski ("Magyar") wziął się jakby z niczego, bo żadne z osób E, A, B i AB go nie ma. Podobnie Wielka Brytania ("Great Britain"). Czyli jakieś 30% jest przypisane do niewłaściwego regionu.

FCD

  • 44% West Slavic
  • 12% East Slavic
  • 23% Baltic
  • 11% Greece & Balkans 
  • 11% Great Britain

Tu również "wyczarowała" się Wielka Brytania, a Grecja i Bałkany zostały "przekazane" od osoby CD, mimo że przodkowie C i D wcale tego regionu nie mają.

Wreszcie spójrzmy, jak wygląda "pochodzenie etniczne" osoby ABCDEF.

ABDCEF

  • 34% West Slavic
  • 19% East Slavic
  • <1% Magyar
  • 23% Baltic
  • 6% Basque
  • 11% Greece & Balkans
  • 3% Great Britain
  • 5% Ireland

Jeśli porównamy to tylko z rodzicami tej osoby, to z nikąd wziął się jedynie komponent Basków ("Basque") o dość wysokim procencie 6%. Jeśli spojrzeć o pokolenie wyżej, to pod znakiem zapytania staje Wielka Brytania. Grecję i Bałkany można podpiąć pod geny od przodka E, choć on miał tylko 9% a nie 11%. Chyba nie tak źle, mieć bezsensownie oszacowane 11% (6% + 3% + 2%)?

 

Podsumowując, na wyniki pochodzenia etnicznego trzeba patrzeć z dużym przymrużeniem oka, ponieważ nawet przy porównaniu rodziców z dziećmi można dostać zupełnie inne wyniki, nowe regiony i tym podobne.